Implanttihoito on yleensä kolmivaiheinen:

• Vaihe 1 (kirurginen): Implantin eli keinojuuren asennus.
• Vaihe 2 (entisöivä hammashoito): Implantin luuduttua siihen kiinnitetään ikenen läpi tuleva rakenne.
• Vaihe 3 (entisöivä hammashoito): Lopullisen kruunun tai proteesin asennus. Alla esimerkki tyypillisen, yhden hampaan korvaamisesta keinojuurihoidolla.

Vaihe 1 (kirurgi)
Ensimmäinen tapaaminen: Tutkimus ja hoitosuunnitelma.
Toinen tapaaminen: Implantin asennus. Joissakin tapauksissa on mahdollista jo tässä vaiheessa panna myös tilapäinen kruunu.
Kolmas tapaaminen (10-14 päivää): Ommelten poisto.
Neljäs tapaaminen (4 viikkoa): Tarkistuskäynti jossa varmistetaan tervehtyminen.
Viides tapaaminen (3-6 kuukautta): Implantti paljastetaan mikäli ien on peittänyt sen. Keinojuureen kiinnitetään ikenen toipumista edistävä tuki. Hammaslääkärille ilmoitetaan että implantti on valmis kruunun asentamista varten. Kaikki hammaslääkärin tarvitsemat osat sekä tiedot toimitetaan hänelle.

Vaihe 2 (hammaslääkäri)
Hammaslääkäri poistaa väliaikaiset rakenteet ja ottaa muotin sekä ylä- että alaleuasta. Nämä lähetetään hammaslaboratorioon, jossa tehdään tarvittavat kiinitysrakenteet sekä kruunu.
Ensimmäinen tapaaminen: Kruunun lopullinen muotti otetaan ja lähetetään laboratorioon.

Vaihe 3 (hammaslääkäri)
Ensimmäinen tapaaminen: Lopullinen kruunu istutetaan paikoilleen, purenta tarkistetaan ja kruunu hiotaan tarpeen mukaan.
Hoidossa voi olla useita muunnelmia. Ihanteellisessa tapauksessa voi olla mahdollista asentaa implantti ilman ikenen isompaa avaamista, käyttäen vain pientä lävistystä leukaluuhun pääsemiseksi. Tässä tapauksessa ikenen tervehtymistä edistävä tuki voidaan panna paikoilleen jo kirurgin toimesta, eikä ikenen uutta avaamista tarvita (viides tapaaminen). Toisaalta, kirurgia voi paljastaa että luuta on.